Para usar mais de uma conta do Skype no mesmo computador ao mesmo tempo, é preciso iniciar uma nova instância do Skype.
- Na barra de tarefas do Windows, clique em Iniciar > Executar (Start > Run), ou pressione as teclas Windows e R no teclado ao mesmo tempo.
- Na janela Executar (Run), digite o seguinte comando (incluindo as aspas) e clique em OK:
Para sistemas operacionais de 32 bits:
"C:\Program Files\Skype\Phone\Skype.exe" /secondary
Para sistemas operacionais de 64 bits:
"C:\Program Files (x86)\Skype\Phone\Skype.exe" /secondary
Se receber uma mensagem de erro, copie e cole o comando exato desta página e tente novamente.
Lembre que se você alterou o caminho de instalação do Skype, será necessário digitar o caminho correto do arquivo Skype.exe.
Se essa solução não funcionar, tente outra opção:
- Encontre o arquivo Skype.exe em C:\Program Files\Skype\Phone\ se estiver usando um sistema operacional de 32 bits.
- Clique com o botão direito no arquivo e selecione Enviar para > Área de trabalho (criar atalho) [Send to > Desktop (create shortcut)].
- Localize o atalho na área de trabalho, clique com o botão direito nele e selecionePropriedades (Properties).
- No campo Destino (Target) da guia Atalho (Shortcut), adicione /secondary no fim do caminho. O campo Destino (Target) agora deve ser "C:\Program Files\Skype\Phone\Skype.exe" /secondary.
- Clique em OK. Agora você pode iniciar uma nova instância do Skype toda vez que clicar duas vezes no novo atalho.
Se estiver usando um sistema operacional de 64 bits, encontre o arquivo em C:\Program Files (x86)\Skype\Phone\.
Fonte: https://support.skype.com/pt/faq/FA829/como-faco-para-usar-varias-contas-do-skype-no-windows-desktop